Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
O00370 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
O00370 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
O00370 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
O00370 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
O00370 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
O00370 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
O00370 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
O00370 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms