Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA8SH3BPF8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms