Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E9PCH4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E9PCH4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
E9PCH4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
E9PCH4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E9PCH4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E9PCH4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E9PCH4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms