Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DEV8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B4DEV8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B4DEV8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
B4DEV8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DEV8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DEV8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms