Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms