Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM90A7PA6NKC0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM90A7PA6NKC0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms