Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLTPD2A6NH11 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLTPD2A6NH11 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms