Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNDIG1LA6NDD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms