Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms