Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms