Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX75

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YX75 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YX75 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YX75 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YX75 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YX75 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YX75 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YX75 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YX75 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YX75 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YX75 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YX75 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YX75 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YX75 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YX75 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms