Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 BEST3-203ENST00000331471 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CADM2-203ENST00000407528 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AP002381.1-201ENST00000439829 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZEB1-AS1-203ENST00000441257 585 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL445189.2-201ENST00000447543 259 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TMEM97P1-201ENST00000452969 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OSBPL10-AS1-207ENST00000455961 411 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL156P-201ENST00000480334 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPL7AP8-201ENST00000481963 804 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DLX5-202ENST00000486603 1074 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MIR3945HG-202ENST00000511703 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC109635.2-201ENST00000525654 524 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AP002812.5-201ENST00000530972 712 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PRSS58-201ENST00000547058 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC010809.2-201ENST00000560404 964 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC106037.1-201ENST00000584148 336 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF880-206ENST00000600321 953 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC010385.2-201ENST00000603743 490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC007663.4-201ENST00000608275 631 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ADAL-208ENST00000610420 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC092656.1-201ENST00000503243 2097 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LETMD1-228ENST00000550929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GNPDA2-201ENST00000295448 1930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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