RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547058.6

PRSS58-201, Transcript of serine protease 58, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRSS58, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS58-201ENST00000547058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.03■■□□□ 1.12
PRSS58-201ENST00000547058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PRSS58-201ENST00000547058 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.86■□□□□ 0.93
PRSS58-201ENST00000547058 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.72■□□□□ 0.75
PRSS58-201ENST00000547058 ABCC9O60706 1549 aa19.28■□□□□ 0.68
PRSS58-201ENST00000547058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
PRSS58-201ENST00000547058 NACADO15069 1562 aa18.52■□□□□ 0.56
PRSS58-201ENST00000547058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRSS58-201ENST00000547058 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PRSS58-201ENST00000547058 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.42■□□□□ 0.54
PRSS58-201ENST00000547058 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PRSS58-201ENST00000547058 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.28■□□□□ 0.52
PRSS58-201ENST00000547058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.24■□□□□ 0.51
PRSS58-201ENST00000547058 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.15■□□□□ 0.5
PRSS58-201ENST00000547058 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.01■□□□□ 0.47
PRSS58-201ENST00000547058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
PRSS58-201ENST00000547058 SCRIBQ14160 1630 aa17.9■□□□□ 0.46
PRSS58-201ENST00000547058 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.88■□□□□ 0.45
PRSS58-201ENST00000547058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.74■□□□□ 0.43
PRSS58-201ENST00000547058 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
PRSS58-201ENST00000547058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.47■□□□□ 0.39
PRSS58-201ENST00000547058 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.36■□□□□ 0.37
PRSS58-201ENST00000547058 FOXD1Q16676 465 aa17.32■□□□□ 0.36
PRSS58-201ENST00000547058 SMARCA4P51532 1647 aa17.14■□□□□ 0.33
PRSS58-201ENST00000547058 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PRSS58-201ENST00000547058 NCAPD3P42695 1498 aa17.06■□□□□ 0.32
PRSS58-201ENST00000547058 SMARCA2P51531 1590 aa17.06■□□□□ 0.32
PRSS58-201ENST00000547058 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.05■□□□□ 0.32
PRSS58-201ENST00000547058 HMGXB3Q12766 1538 aa17.02■□□□□ 0.32
PRSS58-201ENST00000547058 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.01■□□□□ 0.31
PRSS58-201ENST00000547058 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.99■□□□□ 0.31
PRSS58-201ENST00000547058 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.96■□□□□ 0.31
PRSS58-201ENST00000547058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PRSS58-201ENST00000547058 WIZO95785 1651 aa16.76■□□□□ 0.27
PRSS58-201ENST00000547058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PRSS58-201ENST00000547058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.66■□□□□ 0.26
PRSS58-201ENST00000547058 NESP48681 1621 aa16.65■□□□□ 0.26
PRSS58-201ENST00000547058 ERCC6Q03468 1493 aa16.63■□□□□ 0.25
PRSS58-201ENST00000547058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PRSS58-201ENST00000547058 POTEDQ86YR6 584 aa16.58■□□□□ 0.24
PRSS58-201ENST00000547058 CUX2O14529 1486 aa16.56■□□□□ 0.24
PRSS58-201ENST00000547058 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.52■□□□□ 0.24
PRSS58-201ENST00000547058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PRSS58-201ENST00000547058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.5■□□□□ 0.23
PRSS58-201ENST00000547058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.5■□□□□ 0.23
PRSS58-201ENST00000547058 CFTRP13569 1480 aa16.44■□□□□ 0.22
PRSS58-201ENST00000547058 PRDM2Q13029 1718 aa16.38■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.37■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.36■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.36■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.35■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 WDR62O43379 1518 aa16.35■□□□□ 0.21
PRSS58-201ENST00000547058 MSH5O43196 834 aa16.29■□□□□ 0.2
PRSS58-201ENST00000547058 ADRA2BP18089 450 aa16.23■□□□□ 0.19
PRSS58-201ENST00000547058 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.23■□□□□ 0.19
PRSS58-201ENST00000547058 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PRSS58-201ENST00000547058 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PRSS58-201ENST00000547058 TOPBP1Q92547 1522 aa16.09■□□□□ 0.17
PRSS58-201ENST00000547058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.09■□□□□ 0.17
PRSS58-201ENST00000547058 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.09■□□□□ 0.17
PRSS58-201ENST00000547058 ABCC8Q09428 1581 aa16.09■□□□□ 0.17
PRSS58-201ENST00000547058 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRSS58-201ENST00000547058 IFT140Q96RY7 1462 aa16.02■□□□□ 0.15
PRSS58-201ENST00000547058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRSS58-201ENST00000547058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRSS58-201ENST00000547058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRSS58-201ENST00000547058 CUX1P39880 1505 aa15.93■□□□□ 0.14
PRSS58-201ENST00000547058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRSS58-201ENST00000547058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.89■□□□□ 0.13
PRSS58-201ENST00000547058 WDR97A6NE52 1622 aa15.86■□□□□ 0.13
PRSS58-201ENST00000547058 SOGA1O94964 1423 aa15.83■□□□□ 0.12
PRSS58-201ENST00000547058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.83■□□□□ 0.12
PRSS58-201ENST00000547058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.8■□□□□ 0.12
PRSS58-201ENST00000547058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
PRSS58-201ENST00000547058 TOP2BQ02880 1626 aa15.78■□□□□ 0.12
PRSS58-201ENST00000547058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 SYNJ1O43426 1573 aa15.75■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.75■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 CHD1O14646 1710 aa15.74■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.73■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 OSCARQ8IYS5 282 aa15.73■□□□□ 0.11
PRSS58-201ENST00000547058 GRIN2BQ13224 1484 aa15.71■□□□□ 0.1
PRSS58-201ENST00000547058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
PRSS58-201ENST00000547058 PBRM1Q86U86 1689 aa15.7■□□□□ 0.1
PRSS58-201ENST00000547058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.69■□□□□ 0.1
PRSS58-201ENST00000547058 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.67■□□□□ 0.1
PRSS58-201ENST00000547058 SYNJ2O15056 1496 aa15.62■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.59■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.59■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.59■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.58■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 ADAMTS12P58397 1594 aa15.58■□□□□ 0.09
PRSS58-201ENST00000547058 ARHGEF11O15085 1522 aa15.58■□□□□ 0.08
PRSS58-201ENST00000547058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.57■□□□□ 0.08
PRSS58-201ENST00000547058 FBLN2P98095 1184 aa15.55■□□□□ 0.08
PRSS58-201ENST00000547058 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PRSS58-201ENST00000547058 GRIN2AQ12879 1464 aa15.51■□□□□ 0.07
PRSS58-201ENST00000547058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.5■□□□□ 0.07
PRSS58-201ENST00000547058 NUP160Q12769 1436 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms