Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHB7Q9Y5E2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB7Q9Y5E2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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