Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms