Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRXN3Q9Y4C0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms