Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms