Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms