Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms