Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOD1Q9Y239 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms