Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB23Q9ULC3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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