Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms