Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX20Q9UHI6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms