Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms