Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPHA6Q9UF33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA6Q9UF33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms