Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms