Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms