Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRBP1Q9P2E9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms