Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms