Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms