Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIS18AQ9NYP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms