Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms