Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms