Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT6Q9NWK9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms