Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms