Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC3Q9NUD5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms