Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms