Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms