Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO4Q9NRQ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO4Q9NRQ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO4Q9NRQ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms