Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms