Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms