Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms