Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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