Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms