Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCBP2Q9H190 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms