Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms