Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1EQ9GZS1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms