Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCL11BQ9C0K0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCL11BQ9C0K0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms