Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms