Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms